由EDF自1997年起自主研发的一款通用计算流体力学开源软件

用于分子和固体的电子结构计算和分子动力学模拟

是一种快速灵敏的比对程序，用于将下一代测序读数（包括DNA和RNA）映射到人类基因组群体（以及单个参考基因组）

深腾7000，2.3Pflops(0.7CPU+1.6GPU)，元”超级计算系统

免费的开源软件包，用于通过有限差分时域（FDTD）方法模拟电磁系统

进行HF，DFT，MP2计算最快最稳定的代码之一

被广泛承认并应用的分子动力学模拟程序，用于生物大分子的模拟

以做耦合簇见长的从头算程序，同时也支持HF、微扰、CI、QCI计算

可以拼接来自多个平台的测序数据

基于隐马尔可夫模型,用于生物序列分析工作的一个非常强大的软件包,它的一般用途是识别同源蛋白或核苷酸序列和进行序列比对

使用标准量子力学方法描述电子波函数或密度，计算分子和周期性系统的特性，还可进行经典分子动力学和自由能模拟

一款著名的从头算分子动力学软件

可用于计算从周期性体相晶体到纳米结构多种材料（如二维平面、一维线和分子）的准粒子性质和光学响应

一种渐进的多序列比对方法,先将多个序列两两比对构建距离矩阵,反应序列之间两两关系

半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学软件

一款用于处理火灾驱动的流体流动的计算流体力学CFD软件

密度泛函平面波赝势代码，一款用于分子动力学从头计算的开源软件

一款开源的从头计算量子化学软件

通过蛋白质结构域和功能位点数据库预测蛋白质功能

宇宙学和天体物理研究中经常用到的一款重要的程序包

从头计算、DFT和半经验的从头电子结构SCF-MO程序包，可以处理环境的影响和相对论效应，特别着重于开壳层分子的光谱计算

一个针对不同的的流动编写不同的C++程序集合

免费，用于电子结构计算和材料建模的从头算量子化学方法的软件套件

一款从头计算软件，在多体微扰论及含时密度泛函理论框架下计算电子系统的准粒子能量和光学性质

Wannier90使用Marzari和Vanderbilt的方法(MV)进行最大局域化瓦尼尔函数计算

国家超级计算深圳中心（深圳云计算中心）系深圳市人民政府批准成立的企业化管理事业单位，属国家863计划、广东省和深圳市重大项目。主机系统2010年5月经世界超级计算机组织实测确认，运算速度达每秒1271万亿次，排名世界第二。

用于大型和复杂宏基因组学NGS读取的单节点汇编程序，例如土壤

性能与VASP不相上下，基于PAW方法和ASE的密度泛函理论（DFT）Python代码

并行ClustalW

一款用于结构分析的有限元软件，适合固体、流体、传热等多领域问题，集成了前后处理和求解器